现代医学认为，之所以会发生直肠脱垂，是由于肛门直肠周围的支持组织有先天性缺陷、发育不良或衰退，不能给直肠以充分的支持，结果使直肠向下移位、脱出肛门。所以，凡是能削弱支持、固定肛门直肠组织对肛门直肠起支持、固定作用的因素都是直肠脱垂的病因。这些病因归纳起来有三个方面。

（1）支持组织软弱无力：如久病体弱、年迈体衰、全身营养不良等可使支持组织软弱无力。

（2）支持组织疲劳损伤：便秘、慢性腹泻、慢支咳嗽、多次分娩等使腹内压持续增加，支持组织在的高压力下疲劳损伤，失去对肛门直肠的固定作用。

（3）神经受损或功能失调：腰骶神经的损伤，肛门部神经功能的失调，使肛门括约肌松弛无力，造成大便失禁，直肠黏膜脱垂等。